В 1997 году ОКВД аккредитован по второй категории с выдачей лицензии на заявленные виды деятельности сроком на три года.
В этот год в диспансер приходят врачи-дерматове- нерологи: Ирина Ильинична Никишина и Анжелика Николаевна Клеменова.
1997 год для ОКВД стал началом внедрения в практику лабораторной диагностики двух новых реакций: реакции пассивной гемагглютинации бледных трепонем (РПГА) и полимеразной цепной реакции (ПЦР).
17 ноября 1997 года в ТОКВД была открыта ДНК-лаборатория.
В марте 1998 года Г. Г. Четвертак принята на должность заместителя главного врача по поликлиническому отделению, заведующим эпидемиологическим отделом становится Н. С. Левчик.
В январе этого года в лабораторию приходит врач-лаборант А. В. Логвиненко, а в поликлинику — врач-дерматовенеролог Л. М. Омских.
22 февраля 2000 года ТОКВД исполнилось 75 лет, в связи с чем в «Кволити Отеле Тюмень» прошла Всероссийская научно-практическая конференция «Ак- туальные вопросы дерматовенерологии», приуроченная к юбилею диспансера.
Диспансер в 2000 году при лицензировании получил 1 категорию.
В 2000 году А. Б. Котельникова переведена на должность заведующей организационно-методическим отделом.
С сентября 2002 года на должность заведующего отделением дерматологии диспансера принят врач-дерматовенеролог, к. м. н. Сергей Викторович Гольцов.
В бактериологической лаборатории внедрена санитарная бактериология, проводятся смывы с объектов внешней среды, контроль воды, контроль стерильности инструментов.
В феврале 2002 года Н. С. Левчик награжден почетным званием «Заслуженный врач РФ».
В феврале 2003 года В. В. Кузовлев переведен на должность заведующего хозрасчетным отделением.
В июне 2003 года в честь Дня медицинского работника награждены Почетными грамотами Министерства РФ: А. И. Жмурова — заведующая аптекой, Л. Е. Макарова — заместитель главного врача по лечебной работе, Л. П. Попова — врач лаборатории.
В результате изменения структуры системы здра- воохранения и оптимизации деятельности ЛПУ в состав ТОКВД вошел Тобольский КВД и Ишимский КВД.
В январе 2004 года в бак. лаборатории внедрен количественный метод посева на микоплазму в плотной среде.